文章目录

1 资料与方法

1.1 筛选黄芪的有效化学成分和治疗疾病靶点

1.2 疾病-药物-主要成分-靶点网络可视化

1.3 蛋白质互作网络构建和核心作用靶点筛选

1.4 GO和KEGG富集分析

1.5 分子对接验证

2 结果

2.1 黄芪有效成分筛选

2.2 预测药物-疾病靶点

2.3 疾病-药物-关键药物分子-靶点网络构建

2.4 蛋白质互作核心网络构建

2.5 GO和KEGG富集分析结果

2.6 分子对接验证

3 讨论

文章摘要:目的:通过网络药理学方法和分子对接技术研究黄芪治疗糖尿病周围血管疾病（diabetic peripheral vascular disease, DPVD）的作用靶点及分子机制,并推测可能的关键作用成分。方法:通过TCMSP数据库筛选黄芪的活性成分及对应的分子靶点。以关键词"Diabetic Peripheral Vascular Disease"在GeneCards和OMIM数据库中寻找疾病的对应靶点,与药物靶点取交集获得黄芪治疗DPVD的主要靶标。构建"药物-疾病-靶点"的可视化网络图与蛋白互作网络图,运用MCODE插件进行核心靶点基因筛选。运用R语言数据包对主要靶标进行GO功能和KEGG富集分析。通过TCMSP网站下载黄芪主要成分的mol2结构式,通过蛋白质结构数据库PDB网站下载核心靶点蛋白PDB结构式,通过Autodock Tools对药物和基因靶点结构式进行加氢,计算电荷,合并非极氢操作,运用Autodock vina进行分子对接操作。结果:经过筛选,共获得黄芪有效成分20个,其中主要作用成分16个,DPVD的分子靶点共7 469个,黄芪与DPVD的共同靶点98个。通过MCODE插件筛选获得蛋白互作网络10个核心基因。富集得到GO主要生物信号20个,提示黄芪在治疗DPVD中主要涉及肽结合活性,酰胺结合活性,丝氨酸水解酶活性等。富集得到KEGG主要信号通路20条,主要涉及G蛋白耦联受体活性,肾上腺素能受体活性,类固醇激素受体活性,抗氧化活性等。分子对接结果提示黄芪核心成分大部分能够与核心靶点产生稳定结合,其中黄芪异黄烷苷、白桦脂酸、叶酸与DPVD核心靶点产生强烈结合活性,提示其可能是黄芪治疗DPVD的核心组分。结论:黄芪可以通过多靶点调控DPVD的多条信号通路,黄芪异黄烷苷、白桦脂酸、叶酸可能是黄芪治疗DPVD的关键组分。

文章关键词:

论文DOI:10.16368/j.issn.1674-8999.2021.12.549

论文分类号:R285